Nyan Koi! Tập 1 - 2 Chuyện kể về Junpei Kousaka, một anh chàng học sinh cấp 3 "khổ sở" vì một lý do oái oăm: Cậu bị dị ứng mèo! Điều này hẳn là một cơn ác mộng đối với Junpei, khi cậu chẳng ưa gì lũ mèo đáng yêu và ghét cay ghét đắng mọi thứ liên quan đến chúng.
Thế nhưng, số phận trớ trêu thay lại sắp đặt cho Junpei phải đối mặt với nỗi sợ của mình mỗi ngày. Xung quanh cậu là cả một "đội quân" những người yêu mèo cuồng nhiệt! Gia đình cậu, từ người thân đến bạn bè, ai ai cũng mến mộ loài vật này. Ngay cả cô bạn thuở nhỏ lạnh lùng, và cả cô người yêu xinh đẹp Kae de Mizuno của cậu cũng là một "fan cuồng" của mèo.
Liệu Junpei sẽ làm gì để đối phó với tình huống trớ trêu này? Cậu có vượt qua được nỗi sợ hãi và tìm thấy sự đồng điệu với những người yêu mèo xung quanh mình, hay số phận sẽ đưa cậu vào những tình huống dở khóc dở cười xoay quanh loài vật mà cậu ghét nhất trên đời?